God Eater 3 ist eine Fortsetzung des Action-Rollenspiels mit Third-Person-Perspektive im God Eater-Universum. Das Universum dieser Spiele erzählt vom brutalen Kampf der Menschheit gegen gnadenlose Monster in einer futuristischen postapokalyptischen Welt. Drei Jahre sind seit den Ereignissen von God Eater 2 vergangen und die Erde sieht endlich nicht mehr wie eine Welt aus, in der einst Menschen lebten. Nur die „God Eaters“ können das Gleichgewicht wiederherstellen: Sie müssen erneut gegen eine Armee von Monstern namens „Arags“ kämpfen, die alles zerstören, was ihnen in den Weg kommt.