Super Magbot ist ein rasanter Side-Scrolling-Action-Plattformer, der in einer Science-Fiction-Umgebung spielt. Im Spiel schlüpfen Sie in die Rolle eines Roboterforschers, der sein heimisches Magnetia-System vor einem mächtigen Bösewicht retten muss. Indem Sie die magnetische Polarität ändern, müssen Sie sich Ihren Weg durch verschiedene Level mit unzähligen Plattformen bahnen. Die Hauptfigur verfügt nicht über die Fähigkeit zu springen, sondern bewegt sich nur durch Anziehung oder Abstoßung.