Metal Gear Solid 3: Snake Eater — ein abenteuerlicher Stealth-Action-Titel aus der First-Person- und Third-Person-Perspektive. Snake, der vom Spieler kontrolliert wird, muss sich unbemerkt durch feindliches Territorium schleichen. Dem Helden steht ein beeindruckendes Arsenal an Waffen zur Verfügung (von der Pistole bis zum Granatwerfer), jedoch liegt der Schwerpunkt im Spiel auf Heimlichkeit und der Vermeidung von Konfrontationen mit dem Gegner. Während der Durchführung der Mission findet Snake viele nützliche Gegenstände, darunter Bewegungsmelder und eine „markante“ Pappschachtel, die Snake als Deckung dient.
Ungefähr zwei Drittel der Spielzeit verbringt der Spieler im tropischen Regenwald, wo die geschickte Nutzung der umgebenden Vegetation der Schlüssel zum erfolgreichen Vermeiden von Konfrontationen mit Gegnern ist (zum Beispiel kann der Spieler auf einen Baum klettern oder sich vor einem feindlichen Soldaten im hohen Gras verstecken). Zudem wird ein besonderer Schwerpunkt auf die Verwendung von Tarnung gelegt. Der Radar, der in früheren Spielen verwendet wurde, wurde durch einen einfachen Bewegungsmelder und ein akustisches System ersetzt, die dem zeitlichen Rahmen des Spiels entsprechen.
